Efetuando a sincronização com um NTP externo no Windows 2008 R2.

Acessar o PDC é parar o serviço “Windows Time”:
C:\>net stop w32time

Configurando com o NTP externo a.ntp.br, b.ntp.br, c.ntp.br:
C:\>w32tm /config /manualpeerlist:a.ntp.br,b.ntp.br,c.ntp.br,0x8, /syncfromflags:manual

Iniciando o serviço:
C:\>net start w32time

Comandos Interessantes:

Verificando a configuração:
C:\>w32tm /query /configuration
Informar o horário da última sincronização.
C:\>w32tm /query /status
Define que o computador é uma fonte confiável de horário.
C:\>w32tm /config /reliable:yes

Cancelar o registro do serviço.
C:\>w32tm /unregister
Registra o serviço.
C:\>w32tm /register

Após seguir o passo a passo e executar o comando de sincronização.

C:\>w32tm /resync

Outros comandos que podem funcionar:
w32tm /config /syncfromflags:manual /manualpeerlist:ntp.pop-rs.rnp.br
w32tm /config /update
w32tm /resync